MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 10331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_015184	CTG	2	6	551054	551059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168884
9502	NC_015184	TGC	2	6	551076	551081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168884
9503	NC_015184	CTT	2	6	551084	551089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168884
9504	NC_015184	A	7	7	551133	551139	100 %	0 %	0 %	0 %	325168884
9505	NC_015184	GC	3	6	551140	551145	0 %	0 %	50 %	50 %	325168884
9506	NC_015184	CCG	2	6	551164	551169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168884
9507	NC_015184	GCGA	2	8	551213	551220	25 %	0 %	50 %	25 %	325168884
9508	NC_015184	CT	3	6	551291	551296	0 %	50 %	0 %	50 %	325168884
9509	NC_015184	GCG	2	6	551303	551308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168884
9510	NC_015184	GAC	2	6	551368	551373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168884
9511	NC_015184	CTG	2	6	551384	551389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168884
9512	NC_015184	ATTC	2	8	551520	551527	25 %	50 %	0 %	25 %	325168884
9513	NC_015184	GAA	2	6	551533	551538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168884
9514	NC_015184	GTC	2	6	551594	551599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168884
9515	NC_015184	TGGT	2	8	551604	551611	0 %	50 %	50 %	0 %	325168884
9516	NC_015184	GAT	2	6	551754	551759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168884
9517	NC_015184	T	7	7	551820	551826	0 %	100 %	0 %	0 %	325168885
9518	NC_015184	GCG	2	6	551847	551852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168885
9519	NC_015184	GCC	2	6	551993	551998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168885
9520	NC_015184	CG	4	8	552054	552061	0 %	0 %	50 %	50 %	325168885
9521	NC_015184	GTGC	2	8	552076	552083	0 %	25 %	50 %	25 %	325168885
9522	NC_015184	CCA	2	6	552227	552232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168885
9523	NC_015184	TGG	2	6	552236	552241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168885
9524	NC_015184	GAA	2	6	552269	552274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168885
9525	NC_015184	CAA	2	6	552294	552299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168885
9526	NC_015184	GGCA	2	8	552307	552314	25 %	0 %	50 %	25 %	325168885
9527	NC_015184	CTG	2	6	552317	552322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168885
9528	NC_015184	CAA	2	6	552333	552338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168885
9529	NC_015184	TCGA	2	8	552346	552353	25 %	25 %	25 %	25 %	325168885
9530	NC_015184	GGC	2	6	552372	552377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168885
9531	NC_015184	AAT	2	6	552420	552425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325168885
9532	NC_015184	GAT	2	6	552450	552455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168885
9533	NC_015184	GAT	2	6	552491	552496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168885
9534	NC_015184	GA	3	6	552600	552605	50 %	0 %	50 %	0 %	325168885
9535	NC_015184	TTG	2	6	552668	552673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168885
9536	NC_015184	AGG	2	6	552691	552696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168885
9537	NC_015184	ACT	2	6	552763	552768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168885
9538	NC_015184	TCG	3	9	552975	552983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168886
9539	NC_015184	CAA	2	6	552997	553002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168886
9540	NC_015184	GTC	2	6	553130	553135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168886
9541	NC_015184	CAG	2	6	553181	553186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168886
9542	NC_015184	GA	3	6	553196	553201	50 %	0 %	50 %	0 %	325168886
9543	NC_015184	GC	3	6	553232	553237	0 %	0 %	50 %	50 %	325168886
9544	NC_015184	GC	3	6	553307	553312	0 %	0 %	50 %	50 %	325168886
9545	NC_015184	GCC	2	6	553320	553325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168886
9546	NC_015184	TCTG	2	8	553369	553376	0 %	50 %	25 %	25 %	325168886
9547	NC_015184	CGG	2	6	553393	553398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168886
9548	NC_015184	GGT	2	6	553409	553414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168886
9549	NC_015184	TCA	2	6	553416	553421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168886
9550	NC_015184	CAT	2	6	553423	553428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168886
9551	NC_015184	GAA	2	6	553432	553437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168886
9552	NC_015184	CGG	2	6	553476	553481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168886
9553	NC_015184	ACG	2	6	553605	553610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168886
9554	NC_015184	CAA	2	6	553660	553665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168886
9555	NC_015184	GAC	2	6	553706	553711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168886
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9557	NC_015184	GAA	2	6	553940	553945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168886
9558	NC_015184	CGG	2	6	553999	554004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168886
9559	NC_015184	GAT	2	6	554044	554049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168886
9560	NC_015184	CGA	2	6	554148	554153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168886
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9569	NC_015184	AGCTTC	2	12	554633	554644	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325168886
9570	NC_015184	GCCAGC	2	12	554750	554761	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325168886
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9572	NC_015184	CGA	3	9	554950	554958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168886
9573	NC_015184	CGCTT	2	10	555030	555039	0 %	40 %	20 %	40 %	325168886
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9579	NC_015184	ACA	2	6	555642	555647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168887
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9582	NC_015184	GAC	2	6	556002	556007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168888
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9588	NC_015184	GGC	2	6	556344	556349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168888
9589	NC_015184	GA	3	6	556358	556363	50 %	0 %	50 %	0 %	325168888
9590	NC_015184	CGCGC	2	10	556439	556448	0 %	0 %	40 %	60 %	325168888
9591	NC_015184	TGC	2	6	556503	556508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168888
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9601	NC_015184	GGCGA	2	10	557221	557230	20 %	0 %	60 %	20 %	325168888
9602	NC_015184	GAAG	2	8	557262	557269	50 %	0 %	50 %	0 %	325168888
9603	NC_015184	CTA	2	6	557283	557288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168888
9604	NC_015184	TCG	2	6	557320	557325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168888
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9606	NC_015184	TGA	2	6	557490	557495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168888
9607	NC_015184	CG	3	6	557541	557546	0 %	0 %	50 %	50 %	325168888
9608	NC_015184	GAG	2	6	557560	557565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168888
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9612	NC_015184	GAT	2	6	558534	558539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168889
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9984	NC_015184	TTC	2	6	580955	580960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168918
9985	NC_015184	CG	3	6	581010	581015	0 %	0 %	50 %	50 %	325168918
9986	NC_015184	TTG	2	6	581086	581091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168918
9987	NC_015184	GCG	4	12	581180	581191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168918
9988	NC_015184	TCA	2	6	581217	581222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168918
9989	NC_015184	TGA	2	6	581240	581245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168918
9990	NC_015184	ATC	2	6	581266	581271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168918
9991	NC_015184	CGTAC	2	10	581307	581316	20 %	20 %	20 %	40 %	325168918
9992	NC_015184	TCAG	2	8	581323	581330	25 %	25 %	25 %	25 %	325168918
9993	NC_015184	GC	3	6	581351	581356	0 %	0 %	50 %	50 %	325168918
9994	NC_015184	CAC	2	6	581373	581378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168918
9995	NC_015184	GCT	2	6	581436	581441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168918
9996	NC_015184	CGT	2	6	581478	581483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168918
9997	NC_015184	TGC	2	6	581560	581565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168919
9998	NC_015184	TTC	2	6	581577	581582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168919
9999	NC_015184	CTGTG	2	10	581608	581617	0 %	40 %	40 %	20 %	325168919
10000	NC_015184	GAA	2	6	581662	581667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168919

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